Jiaqian Wu

Charakteryzuj? Si? Zlo?ono?ci? Transkryptomaln? Ssakow Jiaqian Wu

W mojej pracy doktorskiej opisalem zakrojony na szerok? skal? RT-PCR i potok klonowania, który opracowalem w celu uzyskania kilku tysi?cy pelnowymiarowych klonów cDNA ssaków (glównie ludzi i myszy) dla potrzeb NHGRI/NCI Mammalian Gene Collection. W tym czasie, warstwy zlo?ono?ci transkryptomu ssaków nie byly jeszcze w pelni opracowane. W tym projekcie bylem gl?boko zaanga?owany w kwestie strategiczne i konceptualne przy charakteryzowaniu zlo?ono?ci transkryptomów z ró?nych poziomów. Wykorzystuj?c ruroci?g RT-PCR w pol?czeniu z algorytmami przewidywania genów, które wykorzystuj? porównawcze informacje genomowe, z powodzeniem zidentyfikowali?my i zweryfikowali?my eksperymentalnie nowe geny ssaków, takie jak pelnometra?owe homologi genów chorób ludzkich. Ponadto, badalem zlo?ono?c transkryptomów, w tym SNP i alternatywne splatanie w próbkach bialaczek przy u?yciu ilo?ciowego PCR i opracowali?my technologi? analizy ?ladowej w celu zidentyfikowania wielu alternatywnych splatanych transkryptów w jednej reakcji sekwencyjnej. Moje wyniki sugeruj?, ?e alternatywnie splecione transkrypty wykazuj? specyficzn? dla raka regulacj? w gór? lub w dól, a stosunek alternatywnych splecionych izoform mo?e stanowic podstaw? mechanizmu nowotworowego.