Rémi Moine

Développement D'un Outil De Recherche Bibliographique Rémi Moine French edition

Le biologiste dispose de PubMed pour effectuer ses recherches bibliographiques et EndNote pour gérer ses bibliographies. On se propose ici de développer l'outil BIBLIOTROP pour pallier à leurs manques. Nous avons développé une base de données d'articles scientifiques et l'interface l'accompagnant. Cela afin de joindre par exemple des informations sur le Riz contenu dans les trois bases de données suivantes, OryGenesDB, OryzaTagLine et Greenphyl, développées au sein de l'UMR à des publications. Notre outil ainsi développé permet de réaliser des annotations, c'est à dire associer à une publication des mots clés, des notes, de l'information génétique (FST, UniProt, Gene Name, GO). Également d'étendre nos recherches de publications vers les co-auteurs, « related articles » et MeSH terms d'une publication, mais aussi à partir de Gene Name, Gene Ontology, UniProt et FST. Il génère aussi des bibliographies directement ou pour EndNote. BIBLIOTROP constitue donc un outil fonctionnel s'intégrant très bien dans l'existant et proposant de nouvelles perspectives de recherche, tout en facilitant le travail du biologiste afin de compiler et de lier différentes sources d'informations.